Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms