Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK3Q9BYB0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms