Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms