Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms