Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms