Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms