Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms