Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EBF4Q9BQW3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBF4Q9BQW3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms