Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms