Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LGMNQ99538 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGMNQ99538 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGMNQ99538 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGMNQ99538 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms