Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms