Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARXQ96QS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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