Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms