Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96MF0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96MF0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96MF0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96MF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96MF0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms