Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC114Q96M63 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms