Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms