Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms