Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MSANTD3Q96H12 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSANTD3Q96H12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms