Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX11Q96FC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms