Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C18orf8Q96DM3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms