Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102AQ96A19 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms