Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms