Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF1Q92879 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms