Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms