Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms