Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FOXD4L4Q8WXT5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L4Q8WXT5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms