Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSMEM1Q8WWF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms