Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms