Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA3Q8NHX4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA3Q8NHX4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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