Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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