Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms