Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms