Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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