Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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LRRC71Q8N4P6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC71Q8N4P6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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LRRC71Q8N4P6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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LRRC71Q8N4P6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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