Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD4Q8IYR2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD4Q8IYR2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms