Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXZ3

SP8, Transcription factor Sp8, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP8Q8IXZ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP8Q8IXZ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP8Q8IXZ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms