Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERC6Q8IVU3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms