Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HAPLN4Q86UW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms