Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIMS1Q86UR5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIMS1Q86UR5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIMS1Q86UR5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RIMS1Q86UR5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMS1Q86UR5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms