Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms