Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTF1AQ7RTS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms