Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSH2Q76I76 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSH2Q76I76 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSH2Q76I76 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH2Q76I76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms