Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM43BQ6ZT52 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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