Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC141Q6ZP82 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC141Q6ZP82 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms