Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00114Q6XXX2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms