Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms