Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms