Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSSK4Q6SA08 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSSK4Q6SA08 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms