Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTR9Q6PD62 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms