Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms